ได้รับความนิยมอย่างมากในหมู่ผู้ที่ใส่ใจสุขภาพและช็อกโกแลตเลิฟเวอร์ที่ไม่ชอบรสหวาน เพราะอุดมไปด้วยฟลาโวนอยด์ สารต้านอนุมูลอิสระ และแร่ธาตุที่มีประโยชน์ต่อสุขภาพหัวใจและหลอดเลือด อย่างไรก็ตาม การศึกษาล่าสุดจากนักวิจัยมหาวิทยาลัยจอร์จ วอชิงตัน และ ConsumerLab พบว่า 43% ของดาร์กช็อกโกแลตมีสารตะกั่วเกินระดับที่ยอมรับได้ และ 35% มีแคดเมียมเกินมาตรฐานของรัฐแคลิฟอร์เนีย โลหะหนักทั้งสองชนิดนี้เป็นพิษต่อระบบประสาท ทำให้เกิดโรคเรื้อรัง เช่น มะเร็ง และส่งผลกระทบต่อพัฒนาการทางสมองของเด็ก ลดไอคิว และก่อให้เกิดปัญหาสุขภาพในระยะยาว โดยเฉพาะในกลุ่มเด็กเล็กและสตรีมีครรภ์
องค์การอนามัยโลกเตือนว่า เด็กมีความเสี่ยงสูงต่อการดูดซึมโลหะหนักจากช็อกโกแลต เนื่องจากร่างกายของเด็กสามารถดูดซึมสารตะกั่วได้ถึง 100% หากกินในขณะท้องว่าง การศึกษายังชี้ว่า ดาร์กช็อกโกแลตออร์แกนิกมีโลหะหนักปนเปื้อนสูง แม้จะปลูกในสภาพแวดล้อมที่ใช้ยาฆ่าแมลงน้อยก็ตาม ทั้งนี้ ระดับตะกั่วและแคดเมียมในดาร์กช็อกโกแลตที่พบยังสูงกว่าปริมาณเฉลี่ยที่องค์การอาหารและยาของสหรัฐ (FDA) กำหนด ซึ่งเพิ่มความกังวลต่อการบริโภคช็อกโกแลตโดยเฉพาะในกลุ่มผู้ที่มีความเสี่ยง
