鑒於中國大陸新型冠狀病毒感染肺炎疫情持續擴大，中央流行疫情指揮中心特別針對大眾運輸、公眾集會及各級學校、教育機關及團體等訂定相關指引，提供各項防疫措施，以降低感染風險，相關資料置於疾管署全球資訊網「嚴重特殊傳染性肺炎」(武漢肺炎)專區。
29日上午行政院長蘇貞昌及陳其邁副院長至指揮中心聽取各部會報告，指示目前正值防疫關鍵期，再次重申各部會務必動員人力物力全力支援，不得有任何消極怠惰，並透過以往的防疫經驗，降低民眾不必要的恐慌。
據統計，28日國內新增96例嚴重特殊傳染性肺炎通報個案，目前累計通621名個案，含8名確診、386名排除、227名隔離檢驗中。目前8名確診個案狀況穩定，持續住院隔離，醫院及地方衛生單位已依循相關處置流程進行疫情調查及接觸者追蹤等防治工作。8名確定個案接觸者總計460人，其中27人有症狀已通報，先前接觸者轉為確定個案，通報個案中12例二採陰性。
中央流行疫情指揮中心再次呼籲，民眾自國外入境時如有發燒、咳嗽等不適症狀，應主動通報機場及港口檢疫人員；返國14天內如出現上述疑似症狀，可撥打免付費防疫專線1922 (或0800-001922)依指示戴口罩儘速就醫，並請務必告知醫師旅遊史、職業別、接觸史及是否群聚(TOCC)，以及時診斷通報。
