中國大陸武漢市發生不明病毒性肺炎疫情，目前已排除流感、禽流感、腺病毒、嚴重急性呼吸道症候群（SARS）和中東呼吸症候群冠狀病毒感染症（MERS）等呼吸道病原之可能，感染源持續釐清當中。
疾管署於1月5日接獲中國疾病預防控制中心通知，截至當日8時，累積病例為59例，其中重症7例，無死亡病例，個案發病時間介於2019年12月12日至12月29日間，均在武漢市醫療機構隔離治療。目前累計追踪163名密切接觸者，均無發燒等異常症狀，截至目前，尚未發現明顯人傳人現象及醫護人員感染。
因應中國大陸武漢肺炎疫情，疾管署自2019年12月31日啟動由武漢直航入境班機之登機檢疫，已執行10航班，共檢疫867名旅客及機組員，其中8名症狀輕微旅客經評估後返家休息，包含2人就醫後診斷為流感、2人為一般感冒、1為支氣管炎症狀，另3人症狀改善，均由地方政府衛生局持續追蹤關懷。疾管署提醒國人近期將前往中國大陸武漢及鄰近區域，應避免前往華南海鮮市場及接觸禽鳥，返國14日內如出現發燒及呼吸道症狀者，應盡速就醫，並由醫師通報採檢。
