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國內疫情尚未趨緩，新冠疫苗也相繼分配到位，中央鼓勵全民接種疫苗，因此指揮中心6月5日宣布，已編列新台幣40億元預算，自6月7日起，全台公費接種對象，都免付掛號費等醫院行政費用。
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行政院發言人羅秉成日前表示，新提出的紓困預算中，預計再新增224.5億元，用於添購疫苗供全民施打，同時還編列約40億元，將不向民眾收取任何費用，自6月7日起，將以獎勵方式補助醫院，全台灣的公費接種對象，皆不需收取任何費用。
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指揮中心另編列費用補助22縣市政府，及辦理社區和大型接種站的所需經費，以加速全民接種速度，儘早達成群體免疫效果，因此從6月7日起，民眾到醫療院所接種疫苗，可免掛號費和藥事服務費，而醫療院所也能每個月結算一次並向指揮中心請款，全民抗疫，嚴守社區防線。
